故事的所在产生在这个整年都邑弗成思议地开着樱花而出名的新月型岛--初音岛。 梦幻的初音岛上产生了弗成思议的现象，本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年之后，樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园，持续过着校园生活。他的口头禅“好困”消失了，酿成了勤勉努力，热衷体育的开朗青年。此时，他的两个妹妹，两年前离去的朝仓音梦..