毛利侦探事务所突然接到一通威胁德律风。之后，路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了！“蓝色的少年与蓝色的斑马，从天而降的雨……”依据罪人寄来的挑战书，若不克不及解读谜之记号，便无法阻止接下来的爆炸。小五郎和毛利兰在米花市内来回奔忙，却完全找不到破解记号的办法。另一方面，此时的江户川柯南与灰原和少年侦探团一起，沉浸在不雅看最爱的足球竞赛的快乐之中。正当竞赛渐入佳境之时，从兰打来的德律风那里，柯南得知了威胁德律风的事情。柯南为了解读记号独自一人离开赛场，却得知了无人能够阻止的恐怖事实。