2053年，突然涌现的宇宙生命体侵略了地球，直接导致了地球上人口损失过半，在人类方面军还击作战失败之后，日本方面军在富士基地展开了一项名为「Planzet」的最终作战筹划。灵活战士驾驶员明岛年夜志接到了死守作战基地的命令，只许死守禁绝失败，在这场作战前夕，年夜志将自己的妹妹与家人送往平安的火星逃亡。事关人类生死生死的「Planzet」最终打响了，年夜志面对着多于自己数倍的仇敌勇敢的冲了出去，这场人类最后的守卫战就这样打响了……