在动画版故事停止的2年后，作为掩护地球对抗外星威胁者的GGG对犯法组织バイオネット进行追查，但追查的同时GGG卷入了Q零件（Qパーツ）的秘密，此时为了重建三重连太阳系而生的索路11游星主抢走Q零件并成为GGG新的仇敌，为了阻止游星主的意图，GGG前往理应已扑灭的三重连太阳系，并在本地进行最后的决战……